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葡萄牙实行一种包括直接税和间接税的税收体系，所得税和社会保障缴款是雇主和雇员的关键组成部分。葡萄牙的雇主负责从员工工资中预扣所得税，并代表公司和员工缴纳强制性社会保障缴款。理解这些义务对于在该国合规运营至关重要。

葡萄牙的税务年度与公历年度一致，从1月1日开始至12月31日结束。雇主和雇员在向葡萄牙税务局（Autoridade Tributária e Aduaneira - AT）和社会保障机构（Instituto da Segurança Social - ISS）缴纳和申报方面有具体责任。

雇主社会保障和工资税义务

葡萄牙的雇主须根据支付给员工的总薪酬缴纳社会保障（Segurança Social）费用。这些缴款用于各种社会福利，包括养老金、失业和疾病福利。标准的雇主缴款率是总劳动成本的重要组成部分。

根据最新可用信息（2025年的费率通常在年内确认，因此采用2024年的费率作为基础），标准社会保障缴款率为：

这些费率适用于员工的月度总薪资，某些行业或合同类型可能适用特定的例外或制度。雇主负责计算、预扣员工部分，并在次月15日前将雇主和员工的总缴款（雇主+员工部分）支付给Segurança Social。

除了社会保障外，通常没有其他单独的重要“工资税”，除了社会保障缴款之外。然而，雇主还必须管理个人所得税（IRS）的预扣和支付。

雇主依法必须从员工的月度总薪资中预扣个人所得税（Imposto sobre o Rendimento das Pessoas Singulares - IRS）。预扣的金额是员工年度所得税负债的预付款。预扣金额由葡萄牙税务局每年公布的官方预扣表格确定。

这些表格较为复杂，考虑多个因素：

雇主必须使用正确的表格，应用相关税率和扣除额，计算每月预扣金额。所有员工的预扣总额必须在次月20日前缴纳给税务局，并提交每月申报（Declaração Mensal de Remunerações - DMR）。

虽然雇主负责预扣，但员工在年度IRS报税时可以享受各种扣除和免税额。这些扣除可以减少应税收入或最终应缴税款。常见的可扣除支出类别包括：

医疗支出： 医疗咨询、治疗、药品和健康保险费（有限额）。
教育支出： 纳税人及抚养人的学费及相关费用（有限额）。
住房支出： 主要住所的租金或按揭利息（有限额）。
家庭支出： 在某些类型支出（如餐厅、机械师、美发师）中发生的增值税（VAT）的一定比例，需用纳税人的NIF（税务识别号）报告，且有上限。
抚养津贴： 每个抚养人固定金额，年龄较小的子女享有更高的额度。
单身免税额： 单身纳税人的固定金额。
家庭系数（Coeficiente Familiar）： 对于联合申报的已婚夫妇，收入在应用税率前会除以一个系数（通常为2），所得税计算后再乘以同一系数。这通常比分开申报的税负更低。

员工必须保存这些支出的发票，并确保通过e-fatura系统向税务局申报，以获得扣除资格。

葡萄牙的雇主有多项定期的税务和社会保障申报义务：

每月社会保障缴款： 次月15日前支付。
每月IRS预扣（DMR）： 次月20日前申报和支付。该申报详细列出每位员工的收入和预扣税款。
年度报酬申报（Modelo 30）： 汇总向非居民实体或个人支付的款项，须每年提交。
年度IRS申报（Declaração Modelo 3）： 虽然主要由员工申报，但雇主提供必要的收入和预扣信息（通过DMR），供员工申报年度税务。员工申报期通常为次年的4月1日至6月30日。

及时提交申报和支付缴款及预扣税款对于避免罚款、利息和附加费至关重要。

葡萄牙为外国工人和企业提供特定的税收制度和考虑事项：

非习惯居留（NHR）制度： 虽然从2024年起，NHR制度对新申请者已大部分取消，但之前符合条件或符合过渡规则的个人仍可继续享受。NHR制度曾提供对某些外国收入的优惠税率，以及对特定葡萄牙来源收入的统一税率，期限最长10年。新居民若从事特定职业或符合某些投资条件，可能获得类似但调整后的激励措施。
税收协定： 葡萄牙与多个国家签有双重征税协定，旨在防止个人和企业在同一收入上被双重征税，并明确哪些国家对特定收入拥有主要征税权。
常设机构（PE）： 在葡萄牙雇佣员工的外国公司可能无意中形成常设机构，从而引发葡萄牙的企业所得税义务。通过本地实体或Employer of Record（雇主代表）管理员工，有助于控制此风险。
社会保障协议： 葡萄牙与多个国家签有双边社会保障协议，也作为欧盟社会保障协调规则的一部分。这些协议可以确定员工在葡萄牙工作但来自其他国家时，社会保障缴款应在哪个国家缴纳，且可能允许其在本国社会保障体系下继续缴纳（通常需要持有A1证书，适用于欧盟/欧洲经济区/瑞士公民）。

处理这些特殊事项需要仔细分析个人的居留状态、收入性质以及相关的税收协定或社会保障协议。